Para migrar una base de datos MySQL o realizar un clon de la base de datos tenemos que realizar siguiente:

1º Tenemos que exportar la base de datos MySQL en un fichero .sql

mysqldump -user -p nombrebasededatos > basededatos.sql

Nomalmente en -user se suele insertar -uroot

2º Una vez que hemos generado el fichero .sql , lo importamos a la base de datos que queramos

mysql nuevabasededatos < basededatos.sql

Ambos comandos se pueden ejecutar desde cualquier directorio, ya que MySQL coge la ruta de forma automática